Significa que no estaban mintiendo cuando dijeron que querían hacerte daño. Si, de hecho, ahora están tratando de matarte, se puede o no suponer que es su intención. En otras palabras, no puedes estar seguro, pero corre por tu vida de todos modos, ciertamente te van a hacer daño.
Ahora la gente siempre dice eso con enojo, pero rara vez como una afirmación definitiva. La mayoría de las veces, la gente no quiere decir que te matarán, pero están claramente muy enojados. Lamentablemente, usamos esa expresión con demasiada facilidad, y el significado rara vez es la intención en esos casos. Pero si te atacan, puedes asumir que quieren lastimarte por lo menos.