¿Por qué naturalmente agito mi café en sentido contrario a las agujas del reloj?

Porque es más fácil abrir la mano hacia la derecha que hacia la derecha; si exagera el movimiento de la agitación, descubrirá que la mayor parte del movimiento es lanzar la mano hacia arriba y hacia la derecha.

La articulación de la muñeca se mueve más fácilmente en esa dirección para una persona diestra.

¿Puedes recordar la primera taza de café que tomaste?
Allí encontrarás la respuesta.
Hay un registro automático en nuestra memoria instintiva de cada instante de nuestra vida, que puede cambiarse pero no borrarse.
Entonces, si tu padre hubiera estado allí y te hubiera visto mezclar el café a tu manera y te hubiera corregido en ese instante y hubieras aceptado la corrección, hoy habrías removido el café en el sentido de las agujas del reloj.
Pero como ya lo has hecho muchas veces, es parte de ti.
Es un simple acto intrascendente, pero el mecanismo es el mismo como fumar, beber demasiado o consumir drogas.
Se puede corregir mediante motivación, convicción o necesidad.
Puedes reemplazarlo pero no borrarlo.

Naturalmente, agita en el sentido de las agujas del reloj porque su muñeca se siente cómoda moviéndose hacia la derecha sin ningún dolor y lo hace con fuerza cero aplicada.

Tal vez por la forma en que escribes tu Os, es automático.

Creo que esto se debe a la forma en que sostienes la cuchara con la mano derecha y la forma de la cuchara y la forma en que funciona tu muñeca, puede que se sienta mejor.